In Tallahassee, Florida , findet am 21. Dezember 1999 ein Gedenkgottesdienst für einen ehemaligen FBI-Agenten namens Raymond Crouch statt. Seine Witwe wird von einem mysteriösen Mann, Mark Johnson, angesprochen, der behauptet, mit ihrem Ehemann zusammengearbeitet zu haben. Nachdem die anderen Trauergäste gegangen sind, kehrt Johnson zum Bestattungsunternehmen zurück, zieht die Kleidung der Leiche an und legt ein Mobiltelefon in den Sarg. Eine Woche später überwacht Johnson Crouchs Grab, als sein Telefon klingelt. er geht mit einer Schaufel auf das Grab zu. Fox Mulder und Dana Scully werden hinzugezogen, um Crouchs leeres Grab zu untersuchen. Sie bemerken Schäden im Inneren des Sarges; Scully vermutet, dass die Szene inszeniert war. Ein Briefing wird von Walter Skinner gehalten , der feststellt, dass Crouch einer von vier ehemaligen FBI-Agenten ist, deren Gräber exhumiert wurden; Alle vier Männer hatten Selbstmord begangen. Aufgrund der Anwesenheit von Ziegenblut rund um das Grab gibt Mulder an, dass es sich bei dem Verbrechen um einen Akt der Nekromantie handelte. Nach der Besprechung nimmt Skinner die Agenten beiseite und bittet sie, Crouchs mögliche Verbindungen zur Millennium Group zu untersuchen. Mulder und Scully gehen in eine Nervenheilanstalt in Woodbridge, Virginia , um Frank Black zu besuchen. Black zögert zunächst, den Agenten zu helfen, da er glaubt, dass jede weitere Zusammenarbeit mit der Millennium Group seinen Sorgerechtsstreit für seine Tochter Jordan behindern könnte. Als Black sich bereit erklärt zu helfen, erklärt er, dass die Mitglieder der Millennium-Gruppe glauben, sie könnten das Ende der Welt herbeiführen, indem sie sich vor Beginn des Jahrtausends umbringen. Aufgrund der Informationen von Black konzentriert sich Mulder darauf, Johnson zu finden, als Scully im Leichenschauhaus von dem toten Deputy angegriffen wird. Die beiden Agenten geben sich alle Mühe, Johnson zu finden, bevor es zu spät ist. Die Agenten suchen nach Mr. Johnson und entdecken Informationen über eine bizarre Reihe wiederbelebter Leichen, die von den Toten auferstehen und nach Opfern suchen. Mulder geht später zu Mr. Johnsons Haus und wird von Johnson in seinem Keller mit einer Gruppe Leichen gefangen, die sich erheben und ihn angreifen. Mulder wird gerettet, als Frank auftaucht und mehreren Zombies in den Kopf schießt. Als die Waffe keine Kugeln mehr hat und der Tod für Mulder und Frank unmittelbar bevorzustehen scheint, kommt Scully und rettet beiden das Leben. Der Epilog zeigt Frank im Krankenhaus mit Scully und Mulder. Scully informiert Frank, dass er Besuch hat und bringt seine Tochter Jordan mit. Währenddessen läuft im Hintergrund Dick Clarks New Year's Rockin' Eve auf einem Fernseher, während der Countdown beginnt. Frank geht und Mulder und Scully bleiben allein zurück. Als die Uhr Null schlägt und die Menge auf der Leinwand „Auld Lang Syne“ zu singen beginnt, küssen sich Mulder und Scully, um das neue Jahr einzuläuten. ( TXF : „ Millennium “)